Higgins Lab - Dynamics of antimicrobial resistance
Wir verwenden Ganzgenomsequenzierung mittels Short- und Long-Read-Sequenzierungsplattformen (Illumina MiSeq bzw. Oxford Nanopore MinION-Plattformen) sowie traditionelle molekularbiologische Methoden, um die Dynamik der antimikrobiellen Resistenz, antimikrobielle Resistenzmechanismen und die molekulare Epidemiologie von krankenhausassoziierten Krankheitserregern (mit Schwerpunkt auf ESKAPE-Organismen) sowie von weiteren bakteriellen Erregern wie Neisseria gonorrhoeae und Mycobacterium tuberculosis zu analysieren. In multizentrischen nationalen und internationalen epidemiologischen Studien untersuchen und verfolgen wir die Übertragung von Bakterien und den Transfer mobiler genetischer Elemente und von Resistenzdeterminanten zwischen Patient und (Krankenhaus-)Umgebung in einem One-Health-Ansatz. Neue Antiinfektiva und Diagnostika sowie der therapeutische Einsatz von Phagen werden ebenfalls erforscht. Wir sind im DZIF HAARBI sehr aktiv und beteiligen uns an verschiedenen multizentrischen Projekten wie AEGON, R-NET und TIARA.
Förderung
Deutsche Forschungsgemeinschaft
Deutsches Zentrum für Infektionsforschung
Center for Molecular Medicine Cologne (CMMC)
Wannigama DL, Amarasiri M, Phattharapornjaroen P, Hurst C, Modchang C, Chadsuthi S, Anupong S, Miyanaga K, Cui L, Fernandez S, Huang AT, Ounjai P, Singer AC, Ragupathi NKD, Sano D, Furukawa T, Sei K , Leelahavanichkul A, Kanjanabuch T, Chatsuwan T, Higgins PG, Nanbo A, Kicic A, Siow R, Trowsdale S, Khatib A, Shibuya K, Abe S, Ishikawa H, Hongsing P, Pathogen Hunters Research Team. Increased Fecal Shedding in SARS-CoV-2 Variants BA.2.86 and JN.1 Compared to Other Omicron Variants. The Lancet Infectious Diseases. 2024. 2024 Mar 21:S1473-3099(24)00155-5.
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Xanthopoulou K, Imirzalioglu C, Walker SV, Behnke M, Dinkelacker AG, Eisenbeis S, Gastmeier P, Gölz H, Käding N, Kern WV, Kola A, Kramme E, Lucassen K, Mischnik A, Peter S, Rohde AM, Rupp J, Tacconelli E, Tobys D, Vehreschild MJGT, Wille J, Seifert H, Higgins PG. Surveillance and genomic analysis of third-generation cephalosporin-resistant and carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae complex in Germany. Antibiotics. 2022. 11; 1289. doi.org/10.3390/antibiotics11101286
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Biehl LM, Higgins PG*, Stemler J, Gilles M, Peter S, Dörfel D, Vogel W, Kern WV, Gölz H, Bertz H, Rohde H, Klupp E-M, Schafhausen P, Salmanton-García J, Stecher M, Wille J, Liss B, Zweigner J, Seifert H, Vehreschild MJGT. Impact of single room contact precautions on hospital-acquisition and transmission of vancomycin-resistant enterococci: a prospective multicentre cohort-study on haematological and oncological wards. Euro Surveill. 2022 Jan;27(2):2001876.
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Xanthopoulou K, Carattoli A, Wille J, Biehl L, Rohde H, Farowski F, Krut O, Vila L, Feudi C, Seifert H, Higgins PG. Antibiotic resistance and mobile genetic elements in extensively drug-resistant Klebsiella pneumoniae sequence type 147 recovered from Germany. Antibiotics (Basel). 2020. Oct 5;9(10):E675.
Gerson S, Lucaßen K, Wille J, Nodari CS, Stefanik D, Nowak J, Wille T, Betts JW, Roca I, Vila J, Cisneros JM, Seifert H, Higgins PG. Diversity of amino acid substitutions in PmrCAB associated with colistin resistance in clinical Acinetobacter baumannii isolates. Int J Antimicrob Agents. 2020. 55: 105862.
Higgins PG, Prior P, Harmsen D, Seifert H. Development and evaluation of a core genome multilocus typing scheme for whole-genome sequence-based typing of Acinetobacter baumannii. PLoS One. 2017. 12:e0179228
